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set WshShell = WScript.CreateObject("WScript.Shell")
WshShell.AppActivate "jw_win"
WScript.Sleep 100
WshShell.SendKeys "{F3}"
WScript.Sleep 750
WshShell.SendKeys "c:\jww\jw_win.jwf"
WScript.Sleep 200
WshShell.SendKeys "{Enter}"

上記をjww.vbs等と名前をつけて保存。
出来たファイルをダブルクリックすれば環境設定ファイルが読み込まれる。
外部変形化を試みたものの、JWWの制御下で開かれるプロンプトはjw_winをアクティブ化できずに固まるため断念。
クリックしやすいところにファイル又はショートカットを置いて切り替え。