外部変形のRVRを利用させていただきたくインストールしたのですが、WEBのサンプル（model_001.js）の様に立体にならず、生成ファイル（Rmodel.js）を確認したことろ、高さ（Y値データ）が全て"0"になっていました。

なにかJW側の設定を確認する個所などありましたら、教えてくださいませ。

Sil~007さんこんにちは。

範囲選択の際に始点を左クリック、終点を右クリックして範囲確定してみてください。
終点を右クリックしないと文字列が選択されないので、それが原因ではないかと思います。